La stagione riparte un anno dopo gli eventi della precedente. Morgana e la malconcia e ormai menomata sorella, Morgause, tornano ad agire durante la mezzanotte del Samhain. Morgause intende sacrificarsi per permettere l'apertura di un velo fra questo mondo e quello dei morti. Terribili creature si riverseranno sulla Terra, pronte a sterminare tutti i loro avversari. Questa parte della storia sarà incentrata sul destino di Emrys, che dovrà impedire a Morgana di distruggere il regno di Re Artù. La serie, anche se resta uno show per famiglie, mostrerà un lato più oscuro, sia dei personaggi che della trama. Entra nel cast un nuovo personaggio, Agravaine de Bois, lo zio di Artù. E' dato anche un magiore ruolo ai Cavalieri della Tavola Rotonda, che appariranno quasi in tutta la stagione. La stagione èvenne trasmessa in Italia dal 10 Settembre al 26 settembre su Italia 1 e viene trasmessa nel paese d'origine, il Regno Unito, dal 1°Ottobre 2011.
- L'ora più oscura per Camelot sopraggiunge quando Morgana stringe un patto con il mondo dei morti. Con i Dorocha che uccidono chiunque trapassi al loro tocco, riuscirà Merlino ad impedire la disfatta di Camelot? (Ep.01)
- Merlino è sull'orlo della morte e viene portato indietro mentre Artù e i suoi cavalieri proseguono verso il velo. Come un sacrificio l'ha aperto, uno ne necessita per celarlo. Chi offrirà la sua vita per richiudere il velo e fermare gli irrequieti spiriti? (Ep.02)
- Uther è condannato. L'unico modo per salvare il re è la magia. Artù si fiderà di ciò che il padre ha combattuto per anni o un nuovo regno è alle porte? (Ep.03)
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